1-

Si on sait dès le départ que son panorama n'a pas d'aller retour mais qu'il a été créé "chronologiquement" dans un sens donné (de droite à gauche ou de gauche à droite), cela pourrait être une idée de proposer à autopano de limiter la recherche pour chaque image aux 3 (voir +, à paramétrer individuellement) images précédentes et 3 images (voir+) suivantes de chaque image. 

Cela éviterai d'avoir la création de liens erronés lorsque des éléments se ressemblent dans l'image pour une raison ou pour une autre (details de batimenent identiques, ciel noir,...).

2-
Un peu dans le même esprit. Autopano nous propose de regarder les liens qu'il juge mauvais après une premier montage. C'est vraiment bien.
Si on sait par défaut qu'il peut pas y avoir des liens entre la 3eme image et la 25eme image, cela pourrait être une idée de simplifier la suppression de lien en ajoutant un bouton supprimer ce lien dès la fenêtre "information générale / qualité d'assemblage". Ainsi, cela éviterai de devoir ouvrir l'éditeur de point de contrôle, de sélectionner tous les points et de les supprimer afin d'annuler des liens "impossible" entre des images.

Panorama